Na temporada de 2013 o São Paulo disputou o Campeonato Paulista, Copa Sul-Americana, Copa Libertadores da América, Recopa, Copa Suruga, Copa Audi, Copa Eusébio e a série A do Campeonato Brasileiro.
No Campeonato Paulista, o time chegou na semifinal e foi eliminado pelo rival Corinthians na disputa de pênaltis após empatarem em 0 a 0.
O São Paulo chegou às oitavas de final da Libertadores. A briga pelo avanço aconteceu com o Atlético Mineiro e o duelo favoreceu o Galo, que ganhou os dois jogos, um por 2 a 1 e o outro por 4 a 1.
Na Copa Sul-Americana o paulista pleiteou uma vaga na final, porém foi eliminado pela Ponte Preta ao perder um jogo por 3 a 1 e empatar o outro em 1 a 1.
A Recopa foi disputada com o Corinthians. Na ocasião, o Tricolor ficou com a segunda colocação, ao perder no Morumbi por 2 a 1 e no Pacaembu por 2 a 0.
O São Paulo passou pela Taça Suruga e Copa Audi e foi eliminado, respectivamente, pelo Kashima Antlers e Bayern de Munique. No torneio da Taça Eusébio, o paulista bateu a Benfica por 2 a 0 e foi campeão.
No Brasileirão, o time correu perto do rebaixamento, mas conseguiu fechar a temporada na 9ª posição com 50 pontos.
Elenco do São Paulo 2013
Goleiros
- Rogério Ceni
- Denis
- Léo
- Renan Ribeiro
Laterais direitos
- Douglas
- Lucas Farias
- Clemente Rodríguez
- Paulo Miranda
- Mateus Caramelo
Zagueiros
- Rafael Tolói
- Lúcio
- Antônio Carlos
- Édson Silva
- Lucão
- Luiz Eduardo
- Roger Carvalho
- Rhodolfo
- João Filipe
- Diego Carlos
- Rodrigo Caio
Laterais esquerdos
- Bruno Cortez
- Juan
- Thiago Carleto
- Henrique Miranda
- Reinaldo
Volantes
- Wellington
- Casemiro
- Allan
- Fabrício
- João Schmidt
Meias
- Paulo Henrique Ganso
- Denílson
- Marcelo Cañete
- Jádson
- Maicon
- Lucas Evangelista
- Gladestony
- Régis
Atacantes
- Luís Fabiano
- Osvaldo
- Roni
- Wallyson
- Welliton
- Adelino
- Ademilson
- Aloísio
- Silvinho
- Negueba
- Tiago Moura
Técnico
- Muricy Ramalho