Na temporada 2003, o São Paulo disputou o Campeonato Paulista, a Copa do Brasil, a Copa Sul-Americana e a Série A do Campeonato Brasileiro.
No Paulistão, o Soberano passou em 2º em seu grupo, com 11 pontos. Nas quartas de final, deixou pelo caminho o Santo André. Na semifinal, duas vitórias sobre a Portuguesa levaram o Tricolor à final contra o Corinthians.
Os primeiros 90 minutos do Majestoso terminou em vitória corintiana (3 a 2). Na volta e pelo mesmo placar (2 a 3), o Corinthians reafirmou sua força sendo campeão e deixando o vice-campeonato para o São Paulo.
Pela Copa do Brasil, a equipe paulista eliminou o São Raimundo-AM e o Gama-DF nas duas primeiras fases. Chegando nas oitavas, com duas vitórias cima do Figueirense, os paulistas se encaminharam para as quartas.
Contra o Goiás o time do Morumbi foi eliminado. No Serra Dourada o jogo o terminou em um empate sem gols (0 a 0). Em casa, o Tricolor cedeu um empate (1 a 1). Pelo critério de gol fora, o São Paulo foi eliminado.
Na Sul-Americana, o São Paulo passou pela fase preliminar vencendo Grêmio e o Vasco. Seguindo às quartas, o time deixou pelo caminho os bolivianos do The Strongest, da Bolívia.
Na semifinal, a equipe paulista encontrou o River Plate, da Argentina. No Monumental, o time argentino mostrou sua força e saiu ganhador (3 a 1). No Morumbi, o Tricolor conseguiu vencer (2 a 0).
O placar agregado levou a decisão para os pênaltis. Diante da torcida são-paulina, o River Plate eliminou os brasileiros nas penalidades (4 a 2).
No Brasileirão com 24 equipes, o São Paulo terminou na 3ª posição. Os 78 pontos somados ao longo das 46 rodadas, renderam uma vaga na Libertadores do ano seguinte.
Elenco do São Paulo de 2003
Goleiros
- Tiago
- Rogério Ceni
- Roger
Laterais direitos
- Gabriel
- Léo Moura
Zagueiros
- Edcarlos
- Júlio Santos
- Diego Lugano
- Emerson
- Jean
- Márcio Costa Saraiva
- Régis
Laterais esquerdos
- Jorginho Paulista
- Fabio Santos
Volantes
- Alexandre Rottweiler
- Renan Teixeira
- Adriano
- Carlos Alberto
- Ale
- Fabio Simplício
- Marcelo Saragosa
Meias
- Kaká
- Ricardinho
- Júlio Baptista
- Souza
- Ailton
- Marco Antônio
Atacantes
- Dill
- Reinaldo
- Kleber
- Luis Fabiano
- Diego Tardelli
- Rico
Técnicos
- Oswaldo de Oliveira
- Roberto Rojas