Na temporada 2005, o Paulista disputou o Campeonato Paulista, a Copa do Brasil e a Série B do Campeonato Brasileiro.
O Galo da Japi começou o ano fazendo uma boa campanha no Estadual. Mais precisamente, ficou na 6ª colocação, com 31 pontos, 14 a menos em relação ao campeão São Paulo. A competição foi disputada em pontos corridos e turno único.
Na Copa do Brasil, o Paulista conseguiu o maior feito de sua história. Avançou por Juventude, Botafogo, Internacional, Figueirense e Cruzeiro, na primeira fase, segunda, terceira, quartas de final e semifinal, respectivamente.
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Em seguida, na finalíssima, teve pela frente o Fluminense, que também buscava o título inédito. No jogo de ida, no Estádio Jayme Cintra, o Galo da Japi venceu sem muitos problemas (2 a 0) e, no confronto de volta, segurou um empate sem gols com o Tricolor (0 a 0), em São Januário, e se sagrou campeão.
No Brasileirão da Série B, no entanto, o Paulista não foi tão bem assim. Na verdade, chegou a flertar com a zona de rebaixamento e terminou a fase de classificação em 15º, com 28 pontos, apenas um a mais em relação ao Vitória, rebaixado na ocasião. Consequentemente, não avançou à segunda fase.
Elenco do Paulista 2005
Goleiros
- Rafael Bracali
- Victor
Laterais direitos
- Lucas da Silva
- Bosco
Zagueiros
- Réver
- Thiago Matias
- Dema
- Anderson Luís
Laterais esquerdos
- Fábio Vidal
- Julinho
Volantes
- Fábio Gomes
- Amaral
- Diego Paulista
- Davi
- Cristian
Meias
- Márcio Mossoró
- Glaydson Marcelino
- Ricardinho
- Elvis Santana
- Fernandinho
- Juliano Spadacio
- Gabriel Elói
- Alex Alves
- Renatinho
Atacantes
- André Leonel
- Victor Santana
- Finazzi
- Wilson Rodrigues
- Abraão Lincoln
- Edu Pacheco
- Jefferson Batista
- Marcos Dias
- Léo Aro
Técnico
- Vagner Mancini
