Na temporada 2006, o Atlético-MG disputou o Campeonato Mineiro, a Copa do Brasil e a Série B do Campeonato Brasileiro.
O Galo começou o ano pelo Estadual e não agradou a torcida. Na fase de classificação, ficou na 3ª colocação, com 22 pontos, atrás de Ipatinga e Cruzeiro.
A equipe alvinegra, no entanto, não passou da semifinal. O adversário foi o arquirrival e caiu com um empate no jogo de ida (2 a 2) e um revés na volta (2 a 0), ambos os confrontos no Estádio Mineirão.
Na Copa do Brasil, o Galão da Massa passou por Atlético Ibirama-SC e Mineiros-GO, na primeira e segunda fase, nessa ordem. Nas oitavas de final, o oponente foi o Fortaleza.
O Alvinegro foi superado em casa pelos cearense (2 a 0) no primeiro encontro, em Minas Gerais, mas deu a volta por cima na volta. No Ceará, a equipe mineira venceu (3 a 1) e se classificou graças ao critério de gol fora.
Chegando nas quartas de final, a equipe atleticana se despediu da competição, diante do Flamengo. No jogo de ida, o Rubro-Negro aplicou uma goleada no Maracanã (4 a 1) e garantiu a vaga na semifinal com o empate no Mineirão (0 a 0).
No Brasileiro da Série B, o Atlético-MG, que encarava sua primeira queda na história, conseguiu voltar e sendo campeão. Mais precisamente, o Galo terminou em 1º com 71 pontos somados, sete a mais que o vice, Sport, e assim se garantiu na Série A do ano seguinte.
Elenco do Atlético-MG de 2006
Goleiros
- Diego Alves
- Bruno
- Edson Lisboa
Laterais direitos
- Luisinho Netto
- Cláudio Roberto
- Tony
- Rodrigo Dias
Zagueiros
- Marcos Joaquin
- Daniel Marques
- Thiago Junio
- Leandro Castan
- Ari Alves
- Lima
- Leandro Cardoso
- Rafael Gomes
Laterais esquerdos
- Thiago Feltri
- André Santos
- Vicente
- Rodrigo Fernandes
- Adriano Junio
Volantes
- Márcio Araújo
- Zé Antônio
- Reginaldo Nascimento
- Renan Garcia
- Bilu
- Henrique Marques
- Rafael Miranda
Meias
- Marcinho
- Ramón Osni
- Jonathan Fabbro
- Rafael Ledesma
- Dinélson
- Tchô
- Marquinho Alves
- Everton dos Santos
Atacantes
- Danilinho
- Marques
- Roni
- Tiago Cavalcanti
- Marinho Reis
- Éder Luís
- Jales
- Alberto Luiz
- Marcelo Pelé
- José Galvão
Técnicos
- Lori Sandri
- Marcelo Oliveira
- Levir Culpi